孝莊文皇后從不直接干預朝政，但對朝政十分關心。她經常告誡康熙帝：“祖宗騎射開基，武備不可弛。用人行政，務敬以承天，虛公裁決。”又說：“古稱為君難，蒼生至眾，天子以一身臨其上，生養撫育，莫不引領，必深思得眾得國之道，使四海咸登康阜，綿歷數于無疆，惟休。汝尚寬裕慈仁，溫良恭敬，慎乃威儀，謹爾出話，夙夜恪勤，以祗承祖考遺緒，俾子亦無疚于厥心。”對這些治國修身之道，康熙帝記于心，用于行。可以這樣說，康熙大帝之所以文治武功大有作為，開創清王朝鼎盛時期，其中也有孝莊文皇后的一份心血。

康熙二十六年九月太后疾病重，康熙皇帝晝夜看視；十二月，康熙步行至天壇，愿減己壽以延長太后之生命。孝莊文皇后病重期間，康熙隔幔看護，水米不進，衣不解帶，日以繼夜。當孝莊文皇后病危之時，康熙號哭不止。康熙二十六年十二月二十五日，孝莊文皇后薨于慈寧宮，年七十五歲。