一直以來，人們都認為金字塔是一種墳墓，而且確實在很多金字塔中找到了木乃伊。那么，瑪雅人會不會是不謀而合也用工程浩大的金字塔作墳墓呢?如果是，為什么金字塔與塔頂上的神龕是這么不相稱，整個塔的建造水平是如此之高，而神龕卻是相當粗糙，這不能不令人懷疑神龕可能是后來加上去的。后來，在金字塔發掘出了一些精致的透鏡、蓄電池、變壓器、太陽系模型碎片、不銹鋼，以及其他不知什么合金制成的機械、工具等。根據這些，人們又推測，金字塔原先很可能是瑪雅祖先的祭壇和用來觀察天象的神壇。

由于瑪雅人對神有種近乎狂熱的崇拜。瑪雅人信奉的神主要有太陽神、雨神、風神、玉米神、戰爭之神、死亡之神等。在瑪雅人看來，神的地界遠比人間凡世豐富偉大。他們經常舉行祭祀典禮，每位瑪雅人都認為，為神獻身是一種非常神圣的事情。因此瑪雅人依照自己的歷法建造的金字塔，實際上都是一種祭祀神靈并兼顧觀測天象的天文臺。這些宏偉遺跡處處顯示的不平凡，使得它與如今比鄰的印第安人居住的茅屋和草棚格格不入，而且這些宏偉的建筑并不是出于實際生活的需要，而是嚴格按照瑪雅人的宗教信仰和神奇的瑪雅歷法建造的，簡直令人難以置信。從考古學家掌握的證據來看，當時瑪雅人仍巢居樹穴，以采集或狩獵為生，過著相當原始的生活，似乎沒有文明前期過渡形態的痕跡;那奇跡般的文化并沒有經過一個由低向高逐漸發展的過程，而似乎是在一夜之間從天而降，驟然間涌現出了各種超越時代的輝煌成就。任何民族對外部世界的認識都必須和他們的生產方式相一致。因而有些學者以此為基點，認為這些建筑不是瑪雅人自己創造的，而是別人傳授給他們的，可是又有誰能把這樣先進的知識傳授給他們呢?